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双峰驼重链抗体基因库的表征

作者:超级管理员      发布日期:2023-05-13 15:51:16

骆驼是唯一能够产生功能性重链抗体(HCAbs)的哺乳动物,抗体(Abs),也称为免疫球蛋白(IGs),是在体液免疫中起核心作用的糖蛋白。所有有颌脊椎动物的常规抗体都是异质分子,由两条相同的重(H)链和两条相同的轻(L)链组成。长期以来,这种四聚体结构一直被认为是Ab的原型,直到在骆驼血清中发现了一种不寻常的Ab亚群,这些特殊的Abs仅由两个相同的H链组成,因此被称为重链Abs(HCAbs)。到目前为止,骆驼科是已知的唯一拥有这些功能性同源二聚HCAbs的哺乳动物。

在骆驼类动物中,HCAbs通常占血清总IgG的10.80%。如此显著的比例证明了HCAbs在骆驼类免疫保护中的重要性。HCAbs和常规抗体的共存使得骆驼类获得了新的抗原受体特性,从而扩大了“抗原空间”的覆盖范围。

通过对7只家养双峰驼和1只野生双峰驼的gDNA文库进行了种系IGHV3基因的高通量扩增子测序,涵盖FR1至FR3,获得了440,460个原始测序reads。在同源度达到99%的序列聚类后,共获得了170个具有代表性的基因(图1)。饱和曲线表明这些序列足以代表种系IGHV3基因库。加入野生双峰驼样本后,基因数量几乎没有增加,这表明种系IGHV3基因库在家养和野生之间的差异不大。

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图1.双峰骆驼生殖系VHH积累的数量和VH

本研究编译了羊驼(VH:43,VHH:17)和单峰驼(VH:50,VHH:42)的IGHV3基因序列,并在所有骆驼科动物中构建了一个邻接(NJ)系统发育树。结果表明,所有VHH基因形成了一个单系进化枝(图2A)。羊驼的序列明显不同于双峰驼和单峰骆驼,这与这些物种的进化距离一致(图2A)。

本研究计算了骆驼科动物中VHs和VHH的核苷酸多样性。如图2所示,双峰驼在VHs和VHs上的核苷酸多样性与单峰驼和羊驼相比略高,可能是由于本研究中更高的测序覆盖率。但是,骆驼科的VHs和VHs的核苷酸多样性都低于非骆驼科的IGHV3基因。

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图2.骆驼和非骆驼物种IGHV3家族中骆驼VHH基因与VH基因核苷酸多样性的比较

根据非典型半胱氨酸的位置,VHH可分为8种类型,在骆驼类中分布不同(图3)。在双峰驼和单峰驼中以2b、2c和3a型为主,在羊驼中以1型和3b型为主。非标准半胱氨酸的存在会形成额外的二硫键,从而扩大VHs的结构多样性,并且这种影响在双峰驼和单峰骆驼中比羊驼更为剧烈。

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图3.基于非典型半胱氨酸位置的VHH类型

论文ID

原名:Characterization of heavy-chain antibody gene repertoires in Bactrian camels
译名:双峰驼重链抗体基因库的表征
期刊:Journal of Genetics and Genomics
IF5.723
发表时间:2022.4
通讯录作者:吉日木图
通讯录作者单位:内蒙古农业大学食品科学与工程学院;
DOI号:10.1016/j.jgg.2022.04.010


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